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목록생명정보학 (7)
슈뢰딩거의 고등어
네. 출근을 했습니다. 목발짚고 버스, 지하철을 타고 갈 엄두가 나지를 않아서 택시를 탔습니다. 택시도 출퇴근 피크시간을 피해서 나름 출발했는데 평소에 30분 컷인 길이 한시간넘게 걸렸지 뭐에요. 그래도 그 동안 많이 회복이 되어서 나름 발을 바닥에 디딜 수는 있는데 그래도 목발을 짚고 다녀야했습니다. 다행히 택시기사님이나 회사건물 경비분이 친절하게 문 열어주고 엘리베이터 잡아주고 하셔서 무사히 출근은 했는데 지문찍고 출근하는 순간 모두의 시선이 꽂히는게 부담이었습니다. 애써 외면하고 자리에 앉아서 업무를 하고 점심시간이 되었습니다. 차마 구내식당까지 갈 용기가 나지 않아서 (굉장히 가파른 계단이 있음) 사무실에서 컵라면을 먹으려고 했습니다. 컵라면에 물을 붓기는 했는데 자리로 다시 가져다 놓는게 굉장히..

스케이트 보드를 타다가 다친 후부터 조금만 무리해도 발에 염증이 생기고 쉽게 아프고 피로해졌습니다. 주사 치료도 잠시뿐이고, 깔창 맞추느라 사용한 비용도 만만치 않았습니다. 결국, 동네병원에서 대학병원에서 수술을 하는 것도 고려해보라고 하셔서 세브란스에 예약을 잡았습니다. 뼈검사와 엑스레이를 찍은 후, 결과를 봤는데... 아픈 발 부분이 까맣게 나왔습니다. 무슨 원리인지는 모르겠지만 너무 신기해서 의사선생님이 한눈파신 사이에 슬쩍 찍어왔습니다. 코로나 시국인지라 입원을 하려면 PCR검사를 받거나 3개월내에 확진되었다가 격리해제가 되었다는 것을 보여줘야했는데 전 안 걸려서 PCR 검사를 했습니다. 세브란스에서 했더니 4,500원 정도 나왔습니다. 면회도 전면금지고 상주보호자는 한명만 가능해서 아버지가 보호..

강의 요약본 1장 1-1바이오메디컬 디지털 영상의 기초 디지털 영상 : 아날로그 영상(자연영상) / ex.바이오 및 메디컬 영상 데이터 디지털 영상(컴퓨터에서 처리하기 위한) 디지털 영상의 장점 모든 신호를 0과 1의 조합으로 표현 가공과 편집이 용이함 잡음에 강함 고화질, 고기능, 저가격화 가능 2차원 아날로그 영상의 디지털화 (2차원 신호인 영상 -> 디지털화) 샘플링 : 공간 영역에서의 디지털화 양자화 : 밝기 값의 디지털화(밝기 값을 이산적으로 나눔) 샘플링 : 공간상의 2차원 함수를 규칙적이고 일정하게 특정한 좌표 x, y에서 존재하는 값으로 표본을 취하는 과정 (표현방법 : 화소, 픽셀) 해상도 : 2차원 공간 영역에서 표본화 된 화소들의 x, y 축 개수의 비율 (높을수록 선명) 양자화 : ..
돌연변이(mutation)란 돌연변이는 DNA sequence 에서 영구적인 변화이다. 돌연변이가 유발되는 과정인 돌연변이생성(mutagenesis) 과정은 여러 원인에 의해 일어날 수 있다. 우선 DNA 복제나 재조합 과정 중 담당하는 효소의 실수에 의해 돌연변이가 유발될 수 있는데 이런 종류의 돌연변이를 자연돌연변이라 한다. 또 다른 돌연변이의 원인은 돌연변이원(mutagen)이라고 하는 물리적 또는 화학적인 요소이다. 자연계에서 가장 흔한 돌연변이원은 X선이나 자외선과 같은 고 에너지 방사선이다. 화학적 돌연변이원은 몇 종류로 나눌 수 있다. 어떤 종류의 화학적 돌연변이원은 정상적인 DNA염기와 비슷한 구조를 갖고 있어 잘못된 염기 결합을 유발하여 돌연변이를 초래한다. 장점 다양성 많은 유전자의 좌..

바이오메디컬 공학 수업 레포트 센트럴 도그마에 대해 알아보고, 단백질에서 유전자의 정보를 얻어내는 것이 가능한지에 대해 의견을 밝힌다. 센트럴 도그마란? 프랜시스 크릭(Francis Crick)이 1958에 발표한 이론으로서 DNA는 복제(replication) 를 하고, 이제 복제된 DNA중 하나를 틀로 삼아 전사(Transcription) 하면 RNA가 되며, RNA를 번역(Translation) 하면 단백질(protein)이 된다는 이론이다. 크릭이 제안한 최초 개념은 유전정보의 방향은 항상 DNA에서 RNA를 통해 단백질을 향한 일방향으로만 흐르며, 반대의 경우는 없다는 것이다. 센트럴 도그마의 과정 DNA는 세포의 핵 속에 있는데, 어떤 단백질을 만들어 낼 지에 대한 유전 정보를 담고 있다, 이..

CAS (Collecting, Analyzing, Sequencing) 서론 기존 플랫폼을 조사해 봤을 때 보험계약 조회+비교+맞춤상품 추천+진료 내역 조회 및 보험금 청구 수준의 1차적인 정보제공 시스템만이 존재하고 있었다. 혹은 분산된 의료정보를 블록체인을 이용하여 개인이 관리할 수 있는 시스템을 구축하고 있었으나 더 나아가 생활에 직간접적으로 연결되는 재화비용과 예방시스템에 관심을 두진 않았다. 따라서 의료정보 뿐 아니라 개인의 유전자 정보와 라이프스타일을 종합한 개인 생애 관리 시스템을 구축한 플랫폼(CAS, Collecting, Analyzing, Sequencing)을 제시하고자 한다. 이 플랫폼은 개인의 건강데이터를 수집하여 의료데이터 생태계를 구축한다. 먼저, 고객의 과거부터 미래까지의 질..
바이오메디컬 공학 수업 레포트 정밀 의료(Precision medicine)는 개인의 유전정보, 환경, 생활 습관 등 환자 개인의 가변성을 고려하여 질병의 조기 진단, 예방 및 처방을 하여 효율성을 극대화하는 것을 말한다. 과거에는 진료 기록과 같은 빅데이터가 있더라도, 사람의 힘으로 이 방대한 데이터를 면밀하게 분석하고 통계적으로 유의미한 모델을 만들어내기가 어려운 경우가 많았다. 때문에 현실적으로 전문가의 직관이나 경험치에 의존할 수 밖에 없었고, 약물 반응성에 대한 부작용을 겪는 환자들 또한 많았다. 하지만 이제 우리는 막강한 연산 능력과 저장 능력뿐만 아니라, 다양한 방식의 인공지능까지 활용할 수 있으므로 의료 빅데이터를 일일이 분석하여 적합한 수학적인 모델을 만들어 개인별 맞춤 의학을 제공할 수..